Το Ειδικό Σχολείο Απ. Βαρνάβας, το οποίο υπάγεται στο Τμήμα Δημοτικής Εκπαίδευσης, ιδρύθηκε και λειτούργησε αρχικά στην πόλη της Αμμοχώστου. Κατά την τουρκική εισβολή, το 1974, το σχολείο έκλεισε δια της βίας και μερικά από τα παιδιά που φοιτούσαν εκεί συνέχισαν να φοιτούν στο Ειδικό Σχολείο «Αγ. Σπυρίδωνας» στη Λάρνακα. Το 1980 το σχολείο επαναλειτούργησε σε παλιό κτίριο στο χωριό Λιοπέτρι της ελεύθερης Επαρχίας Αμμοχώστου.
Με πρωτοβουλία του Συνδέσμου Γονέων και Φίλων του σχολείου άρχισε προσπάθεια για το κτίσιμο καινούριου οικήματος για να μεταφερθούν τα παιδιά. Η πρωτοβουλία του Συνδέσμου Γονέων και Φίλων απέφερε καρπούς και το 1995 ανεγέρθηκε το κτίριο στο οποίο στεγάζεται σήμερα το σχολείο. Στη συνέχεια το κτίριο παραχωρήθηκε στο Υπουργείο Παιδείας και Πολιτισμού. Έκτοτε, έγινε επέκταση του σχολείου, λόγω της σημαντικής αύξησης των μαθητών που φοιτούσαν στο σχολείο, κατασκευάστηκε γήπεδο καλαθόσφαιρας και θεραπευτική πισίνα.
Στο σχολείο φοιτούν μαθητές με αναπηρίες που προέρχονται από χωριά της ελεύθερης επαρχίας Αμμοχώστου (Λιοπέτρι, Αυγόρου, Σωτήρα, Παραλίμνι, Βρυσούλες, Φρέναρος, Δάσος Άχνας, Αγία Νάπα), από χωριά της επαρχίας Λάρνακας (Ξυλοτύμπου, Ξυλοφάγου και Ορμήδεια) και από την κατεχόμενη Αμμόχωστο.